這張地圖整理《自私的基因》中「自私基因如何產生合作」的關鍵問題。親緣選擇與互惠利他是不同機制；演化穩定策略與頻率依賴選擇則用來分析策略互動與穩定條件。
flowchart TD A[合作行為] --> B[親緣選擇] B --> C[包容適存度] C --> D[漢彌爾頓法則] A --> E[互惠利他] E --> F[重複互動與辨識] F --> G[頻率依賴選擇] G --> H[演化穩定策略] A --> I[多層次選擇]
核心概念：合作、親緣選擇、包容適存度、漢彌爾頓法則、互惠利他、演化穩定策略、頻率依賴選擇、多層次選擇。
永久筆記：包容適存度把自身繁殖與親屬效應納入同一計算、親緣選擇描述基因相似者之間的選擇效應、漢彌爾頓法則是有條件的成本效益判準、互惠利他需要重複互動與辨識不合作者的條件、演化穩定策略描述策略互動的抗入侵狀態、頻率依賴選擇使策略收益隨族群比例改變、合作不只是短期交換也可能創造新的個體層次。
靈感筆記：用同一個合作案例比較基因個體群體與生態層次、把合作的穩定性問題轉成社群設計問題、不要用基因演化替社會不平等提供自然化藉口。
文獻筆記：Hamilton 的包容適存度模型說明親屬間利他行為如何演化、Trivers 的互惠利他模型把非親屬合作放進演化分析、主要演化轉變說明合作如何形成新的遺傳與繁殖單位。