基因效應通常不是孤立、線性地從 DNA 指向性狀。基因轉錄、蛋白質與 RNA 活動、細胞訊號、代謝、器官功能與環境刺激會形成多層互動網絡；緩衝與補償機制也可能讓同一基因變異在不同背景中呈現不同結果。這種系統觀補充基因中心的族群演化分析，特別適合處理生理功能與發育機制。
思與行
- 對一個性狀建立基因—細胞—器官—環境多層次圖，而不是只畫基因到性狀的單向箭頭。
- 區分「哪個遺傳變異在族群中被選擇」與「生物系統如何實際產生功能」兩種不同問題。
基因效應通常不是孤立、線性地從 DNA 指向性狀。基因轉錄、蛋白質與 RNA 活動、細胞訊號、代謝、器官功能與環境刺激會形成多層互動網絡；緩衝與補償機制也可能讓同一基因變異在不同背景中呈現不同結果。這種系統觀補充基因中心的族群演化分析，特別適合處理生理功能與發育機制。