細胞代謝路徑負責轉換碳骨架、電子與磷酸基。糖解作用 產生丙酮酸與 NADH；檸檬酸循環 進一步氧化碳骨架；電子傳遞鏈 把還原當量的自由能轉成膜梯度；底物層級磷酸化 則直接形成 ATP。發酵、呼吸作用 與 厭氧代謝 展示不同電子受體和能量保存策略。 相關狀態與測量：NADH、ATP、能量狀態、代謝通量。